救生艇的引擎在劇烈震顫，工藤新一死死攥着琴酒抛出的懷表，表盤内側的微型攝像頭還在持續運轉。

直升機的轟鳴聲越來越近，探照燈的光束如利劍般刺破海面，卻在距離救生艇百米外突然轉向，像是被某種力量牽引着偏離了軌道。

“不對勁！”工藤新一将懷表塞進内袋，指尖觸到冰冷的金屬時，突然想起琴酒臨别前那抹意味深長的眼神。

他轉頭望向戰場方向，琴酒與茱蒂的槍／聲已經漸漸稀疏，取而代之的是某種低沉的嗡鳴，仿佛遠古巨獸在深海蘇醒。

海底深處，一艘漆黑的潛艇緩緩浮出水面。工藤新一瞳孔驟縮，艇身上若隐若現的烏鴉紋章與琴酒懷表上的圖案如出一轍。

艙門開啟的瞬間，赤井務武的身影出現在陰影中，老荷官的金絲眼鏡泛着冷光：“上船，來不及解釋了。”

救生艇剛靠近潛艇，工藤新一便被一股強大的吸力拽入艙内。

艙門重重關閉的刹那，工藤新一看到海面泛起詭異的漣漪，數十條銀色機械觸手從海底探出，将救生艇絞成碎片。

琴酒的戒指在口袋裡發燙，後頸的時空粒子瘋狂跳動，仿佛在警示着某種危機。

“這是組織的秘密潛艇？”工藤新一扶着震顫的艙壁，目光掃過布滿儀表盤的控制室。

赤井務武正在操作台前忙碌，屏幕上跳動的數據流中，赫然夾雜着琴酒的基因圖譜和烏丸蓮耶的全息頭像。

老荷官頭也不回地開口：“準确來說，是二十年前‘潘多拉’号的殘骸改造體。”

記憶如潮水般湧來。

工藤新一想起記憶芯片中的畫面：二十年前，赤井務武與琴酒的父親在實驗室裡激烈争執，桌上攤開的圖紙正是這艘潛艇的設計圖。

“你們早就知道烏丸蓮耶的計劃？”少年偵探的聲音帶着難以置信。

赤井務武終于轉身，鏡片後的目光深邃如淵：“二十年前，我和琴酒的父親試圖阻止時空實驗，卻被組織追殺。‘潘多拉’号表面是科考船，實則是初代時空穿越裝置的載體。”

赤井務武調出一張老照片，照片裡年輕的琴酒站在船頭，身旁的男人與他有着七分相似，“琴酒的父親為了保護兒子，将他的基因樣本和時空粒子數據藏在了這艘潛艇裡。”

工藤新一的太陽穴突突跳動，記憶芯片與後頸紋路産生共鳴。

他看到更多畫面：琴酒八歲那年，父親在實驗室被殺害，臨死前将一枚刻有鸢尾花的戒指塞進他手中；赤井務武暗中收集證據，卻在即将成功時遭遇埋伏，從此銷聲匿迹。

“所以琴酒才會被選為實驗體。”工藤新一喃喃道，“因為他的基因裡藏着打開時空裝置的密鑰。”他握緊口袋裡的戒指，内側的鸢尾花紋路與潛艇控制台的啟動鍵完美契合。

赤井務武點頭，啟動了某個隐藏按鈕。潛艇底部傳來齒輪轉動的聲響，牆壁緩緩升起，露出一個巨大的透明艙室。

工藤新一倒抽一口冷氣——艙室内，無數裝着藍色液／體的培養皿整齊排列，每個培養皿上都标注着不同的時間坐标，而中央的主屏幕上，赫然顯示着烏丸蓮耶的全息投影。

“這是組織的時空檔案館。”赤井務武的聲音低沉而沙啞，“烏丸蓮耶通過克隆技術和記憶移植，試圖将自己的意識注入不同時空的載體。而你和琴酒，正是他選中的完美容器。”

赤井務武調出一段監控錄像，畫面裡，幼年的工藤新一在遊樂園玩耍，暗處有無數雙眼睛在注視。