"分頭找齒輪！"工藤新一抓住零的手腕，"你擅長破解機關，跟我去地下室；琴酒和艾蓮娜負責上層實驗室，小心那些會複制記憶的機械蜘蛛！"

地下二層的通道彌漫着詭異的藍光，牆壁上嵌滿老式膠片放映機。當工藤新一試圖觸碰其中一台時，畫面突然亮起——七歲的宮野志保正在實驗室玩耍，她手中擺弄的正是那個蛇形儀器的雛形。零突然抓住他的肩膀往後拽，千鈞一發之際，一道激光擦着鼻尖射過，将放映機熔成鐵水。

"這些畫面都是陷阱。"零用匕首挑開地面的裂縫，露出下面密密麻麻的齒輪，"但也許......"他突然将匕首刺入自己掌心，鮮血滴落在齒輪上的瞬間，通道牆壁開始重組，露出隐藏的暗門。

與此同時，上層實驗室傳來激烈的交火聲。琴酒的風衣被機械蜘蛛的絲線割開，艾蓮娜的掃描器已經被腐蝕出破洞。

當她舉起自制的電磁脈沖／槍時，琴酒突然扣動扳／機——子／彈穿透她的肩膀，卻在擊中機械蜘蛛的瞬間引發時空震蕩。

"你瘋了？！"艾蓮娜踉跄着後退，琴酒的槍口卻依然對準她："那隻蜘蛛複制了你的記憶，真正的你三小時前就被替換了。"

琴酒踢開地上的殘骸，露出下面刻着鸢尾花的懷表，"這是你哥哥留給你的，仿冒品不會有這個細節。"

地下三層的密室中，工藤新一終于找到最後一個齒輪。

但當他将齒輪嵌入凹槽時，整個空間開始坍縮。老婦人的投影突然出現，聲音帶着絕望："太晚了！阿笠已經完成時空轉換器，他要将所有平行時空的自己融合成......"

劇烈的爆／炸打斷了她的話。

工藤新一被氣浪掀飛，撞在布滿蛇形紋路的金屬門上。當他掙紮着爬起時，零正用匕首撬動門縫，琴酒和艾蓮娜渾身浴血地沖了進來。

實驗室中央，阿笠博士的機械身軀已經成型，他的機械義眼閃爍着紅光，手中握着的量子核心正在吞噬周圍的時空。

"啟動自毀程序！"工藤新一将徽章按在牆壁的凹槽，整個實驗室開始倒計時。阿笠的機械臂突然伸出，将他死死釘在牆上："你以為能改變命運？所有時空的阿笠博士都在等待這一刻——"

千鈞一發之際，老婦人的身影突然出現在機械核心旁。她脖頸處的蛇形紋身發出耀眼光芒，整個人化作數據流注入核心："女兒，這是媽媽最後能為你做的......"

劇烈的爆／炸吞沒了一切。

工藤新一在意識消散前，看見宮野志保幼年時的照片從虛空中飄過，琴酒将艾蓮娜推出實驗室的背影，還有零在煙霧中堅定的眼神。

當白光再次亮起時，他發現自己躺在一條陌生的街道上，遠處鐘樓傳來熟悉的嗡鳴，而口袋裡的徽章，正在緩緩浮現出新的坐标......